La Unidad de Química en Sisal cuenta con dos sedes, la primera en Sisal Yucatán, donde se trabaja principalmente en las líneas de investigación de ciencias ambientales costeras y productos naturales marinos, impulsando el estudio de la química de zonas costeras en México, y en específico de la Península de Yucatán. La segunda sede cuenta con dos laboratorios en el Parque Científico y Tecnológico de Yucatán. Uno de ellos es el Laboratorio de Análisis de Isótopos Estables (LAIE) que se especializa en estudios que utilizan isótopos estables de elementos ligeros. El LAIE es un laboratorio de puertas abiertas que apoya a la investigación y a los sectores productivo y de servicios. El segundo laboratorio es el Laboratorio de Genómica de Enfermedades Complejas, que realiza proyectos en comunidades indígenas, en estudios dirigidos a la atención nutricional de niños(as) mayas, colectividad considerada prioritaria en el Plan Nacional de Desarrollo. El laboratorio ha extendido sus líneas de investigación a la búsqueda de las bases genómicas de enfermedades como litiasis renal y padecimientos mentales que incluyen suicidio y depresión.